Setiap hari sebelum memulai Kegiatan Belajar Mengajar di MTs Wathoniyah Pengarengan telah diterapkan kegiatan pembiasaan, yaitu hafalan Juz'amma dan bahasa Inggris. Kegiatan pembiasaan hafalan juz amma dan bahasa Inggris di MTs Wathoniyah Pengarengan memiliki banyak manfaat. Hafalan juz amma dapat meningkatkan keimanan dan ketaqwaan siswa, sedangkan penguasaan bahasa Inggris akan membuka peluang yang lebih luas di masa depan. Melalui kegiatan ini, diharapkan siswa dapat meraih prestasi baik di bidang akademik maupun non-akademik.
